Так как аппаратные возможности устройства намного шире, встроенное ПО было доработано для реализации дополнительных сервисов.

- Эмуляция модема на USB-порту.
- Доступ к встроенной командной оболочке (диалоговый режим, обновление ПО) по USB через виртуальный COM-порт.
- Встроенный PPP-сервер, превращающий HonixBox в конвертор USB-Ethernet (т.е. HonixBox можно использовать в качестве основной или дополнительной сетевой карты на том компьютере, к которому он подключается по USB).
- Встроенный веб-сервер.
- Встроенный IP-фильтр (firewall).
- Статистика для PPP и ЛС.
- Поддерживаемые протоколы